Les méthodes scientifiques utilisées variant selon l’objet de l’étude. On peut cependant en repérer quelques unes :
- Mesure physico chimique des sols et des zones humides
- Méthode d’estimation statistique et de recensement
- Prélèvement

Quelques études sur le Domaine national de Rambouillet ont permis de recenser la faune et la flore :
1) « Végétation et Flore du Domaine de Rambouillet », D. Derock, Ecologue/Botaniste, Université d’Orsay, 1997. L’étude montre la diversité floristique du Domaine avec certaines espèces rares.
2) « Les Odonates du parc des Chasses présidentielles », Fr. Arnaboldi, ONF-Sylvétude, 1997. L’étude porte sur les ordonates (libellules) et les milieux humides sur le Domaine.
3) « Inventaire entomologique sur le Domaine Présidentiel de Rambouillet », B. Boleat, E. Olive, C. Gagnepain, Entomologistes, Université d’Orsay, 1997. L’étude porte sur les lépidoptères (papillons) et identifie des espèces rares en Ile-de-France.
4) « Qualité des eaux et des mares du Domaine de Rambouillet », F. Leprieur, Ecologue Biologiste, Maître de Conférence Université de Montpellier, 1997. L’étude établit une cartographie des mesures physico-chimiques du Domaine.
5) « Les lépidoptères du Domaine présidentiel de Rambouillet. Recommandation pour une gestion d’un conservatoire pilote », D. Rochat, Physiologiste des insectes, Chercheur INRA Versailles, OPIE, 2002. L’étude insiste sur la richesse de la biodiversité sur Domaine notamment au niveau des papillons.

Recensement d’espèces rares de papillons et de libellules en Île-de-France. La présence de ces espèces rares s’explique par la très grande diversité des milieux sur un espace relativement restreint. Ce milieu a été préservé depuis près d’un siècle et représente à ce titre un laboratoire vivant d’exeption.